教員情報 - 山本　典史 | 千葉工業大学

■ 学位

1.

2001/04～2004/03

九州大学総合理工学研究科量子プロセス理工学専攻博士課程修了博士（理学）

■ 研究概要

ビーカーやフラスコなどの実験器具は使わずに、コンピュータを使って分子を解析する計算化学の研究に取り組んでいます。具体的には、量子化学・分子動力学・機械学習などのさまざまな手法を使って、機能性材料や生体分子の性質や機能を明らかにしようとしています。

実験装置では調べることが難しいミクロな世界の分子のふるまいも、コンピュータでシミュレーションすることで、物質の機能を上手に制御するための指針や生体内の反応が巧妙に支配される仕組みを明らかにすることができます。私たちは、コンピュータを使って化学現象を見ることに挑戦しています。

■ 専門分野

理論化学, 計算化学, 生物物理, 光化学　（キーワード：機能性材料、シミュレーション、分子モデリング、計算化学、理論化学）

■ 所属学会

1.	2015/02～	日本化学会
2.	2016/03～2018/02	∟ 関東支部幹事
3.	2016/10～2018/10	∟ 代議員
4.	2009/09～	分子科学会
5.	2009/07～	日本生物物理学会
6.	2015/09～	分子シミュレーション研究会
7.	2016/10～	情報計算化学生物学会
8.	2012/10～	化学工学会
9.	2012/05～	日本海水学会
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■ 著書・論文・作品

1.	論文	Mechanisms of Aggregation-Induced Emission and Photo/Thermal E/Z Isomerization of a Cyanostilbene Derivative: Theoretical Insights Journal of Physical Chemistry C 122(23),pp.12434-12440 （単著） 2018/05
2.	論文	Hot Spot of Structural Ambivalence in Prion Protein Revealed by Secondary Structure Principal Component Analysis Journal of Physical Chemistry B （単著） 2014
3.	論文	第一原理分子動力学に基づく溶液内化学反応の最小自由エネルギー経路アンサンブル 16,42-48頁（単著） 2014
4.	論文	Ferryl-Oxo Species Produced from Fenton's Reagent via a Two-Step Pathway: Minimum Free-Energy Path Analysis Journal of Physical Chemistry B 116,pp.14178-14182 （共著） 2012
5.	著書	第一原理計算～構造最適化に向けた材料・デバイス別事例集～（共著） 2012
6.	論文	Excited-state intramolecular proton transfer and conformational relaxation in 4'-N,N-dimethylamino-3- hydroxyflavone doped in acetonitrile crystals Physical Chemistry Chemical Physics （共著） 2016
7.	論文	Two isomers of a Cyanostilbene Derivative in Viscous Solution Observed by Fluorescence Spectroscopy Chemistry Letters （共著） 2016
8.	論文	Development of prediction model for CO₂ hydrate film growth incorporating with molecular dynamics simulation Proceedings of the International Conference on Power Engineering-15 （共著） 2015
9.	論文	External Electric Field Effects on Excited-State Intramolecular Proton Transfer in 4'-N,N-Dimethylamino-3-hydroxyflavone in Poly(methyl methacrylate) Films Journal of Physical Chemistry A 119(37),pp.9599-9608 （共著） 2015
10.	論文	Temperature dependent fluorescence spectra arise from change in excited-state intramolecular proton transfer potential of 4'-N,N-dimethylamino-3-hydroxyflavone-doped acetonitrile crystals Chemical Physics Letters （共著） 2015
11.	論文	Infrared spectroscopic studies on 4-amino-6-oxopyrimidine in a low-temperature Xe matrix and crystalline polymorphs composed of double hydrogen-bonded ribbons Chemical Physics Letters 595,138-143頁（共著） 2014
12.	論文	アセトニトリル結晶の相転移がクマリンの励起状態の安定化に及ぼす効果九州大学中央分析センター報告 (32),1-8頁（共著） 2014
13.	論文	A Minimal Implementation of the AMBER-PAICS Interface for Ab Initio FMO-QM/MM- MD Simulation Bulletin of the Chemical Society of Japan 86,210-222頁（共著） 2013
14.	論文	Changes in the electric dipole moments and molecular polarizabilities of enol and keto forms of 2-(2' -hydroxyphenyl)benzimidazole along the proton transfer reaction path in a PMMA film Chemical Physics Letters 539-540,45-49頁（共著） 2012
15.	論文	Excited-state intramolecular proton transfer and charge transfer in 2-(2'-hydroxyphenyl)benzimidazole crystals studied by polymorphs-selected electronic spectroscopy Physical Chemistry Chemical Physics 14,16448-16457頁（共著） 2012
16.	論文	Partial energy gradient based on the fragment molecular orbital method: Application to geometry optimization Chemical Physics Letters 500,pp.149-154 （共著） 2010
17.	論文	Redox behaviors of the neurotoxic portion in human prion protein, HuPrP(106-126) Chemical Physics Letters 498,pp.184-187 （共著） 2010
18.	論文	DFT studies on redox properties of copper-chelating cuprizone: Unusually high-valent copper(III) state Journal Molecular Structure Theochem 895,pp.52-56 （共著） 2009
19.	論文	Difference in redox behaviors between copper-binding octarepeat and nonoctarepeat sites in prion protein Journal of Biological Inorganic Chemistry 14,pp.1209-1218 （共著） 2009
20.	論文	Regulating the Conformation of Prion Protein through Ligand Binding Journal of Physical Chemistry B 113,pp.12853-12856 （共著） 2009
21.	論文	Inner-valence states of N₂⁺ and dissociation dynamics studied by threshold photoelectron spectroscopy and configuration interaction calculation Journal of Chemical Physics 124,pp.234306-1-234306-6 （共著） 2006
22.	論文	二成分クラスターの混合と偏析 (複雑な多谷ポテンシャルエネルギー曲面で生起する動力学諸問題〜タンパク質とその周辺〜研究会報告物性研究 86,130-135頁（共著） 2006
23.	論文	Mixing and segregation in binary clusters (Chaos and Nonlinear Dynamics in Quantum-Mechanical and Macroscopic Systems) 物性研究 84,503-504頁（共著） 2005
24.	論文	Classical trajectory calculations of intramolecular vibrational energy redistribution. I. Methanol-water complex Journal of Chemical Physics 121,pp.2058-2066 （共著） 2004
25.	論文	Classical trajectory calculations of intramolecular vibrational energy redistribution. II. Phenol-water complex Journal of Chemical Physics 121,pp.2067-2070 （共著） 2004
26.	論文	Nonadiabatic transition in the dissociation process from inner valence states of O₂⁺ Journal of Chemical Physics 120,pp.11330-11332 （共著） 2004
27.	論文	A theoretical study of strong anharmonic coupling between OH stretching and bending modes in phenol-water cationic complex Chemical Physics Letters 371,pp.724-730 （共著） 2003
28.	論文	Infrared photodissociation spectroscopy of [aniline-(water)_n]+ (n = 1-8): Structural change from branched and cyclic to proton-transferred forms Journal of Physical Chemistry A 107,pp.4230-4237 （共著） 2003
29.	論文	Inner-Valence states of O₂⁺ and dissociation dynamics studied by threshold photoelectron spectroscopy and a configuration interaction calculation Journal of Chemical Physics 119,pp.7693-7700 （共著） 2003
30.	論文	Pulsed field ionization-ZEKE spectroscopy of 4-aminobenzonitrile-H₂O. Hydrogen-bonding interaction in the amino site Physical Chemistry Chemical Physics 5,pp.1775-1779 （共著） 2003
31.	論文	Structure and bonding of the (C₆H₆)₂⁺ radical Molecular Physics 101,pp.227-232 （共著） 2003
32.	論文	IR-dip and IR-UV hole-burning spectra of jet-cooled 4-aminobenzonitrile-(H₂O)₁. Observation of pi-type and sigma-type hydrogen-bonded conformers in the CN site Chemical Physics 283,pp.209-219 （共著） 2002
33.	論文	Density functional studies on aniline dimer cations Chemical Physics Letters 345,pp.532-538 （共著） 2001
34.	論文	Electronic and infrared spectra of jet-cooled 4-aminobenzonitrile-H_²O. Change of NH from proton acceptor to proton donor by CN substitution Chemical Physics Letters 341,pp.70-76 （共著） 2001
35.	論文	Hole-burning spectra of tropolone-(CO₂)_n [n = 1, 2] van der Waals complexes and density functional study Chemical Physics 270,pp.333-343 （共著） 2001
36.	論文	Hole-burning spectroscopy and ab initio calculations for the aniline dimmer Chemical Physics Letters 342,pp.417-424 （共著） 2001
37.	論文	Electronic and vibrational spectra of aniline-benzene hetero-dimer and aniline homo-dimer ions Chemical Physics Letters 323,pp.43-48 （共著） 2000
38.	論文	Hole-burning spectra of 9-hydroxyphenalenone and its OD derivative. Proton/deuteron tunneling in ¹³C isotopomers Japanese Journal of Deuterium Science 9,pp.15-23 （共著） 2000
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■ 研究題目

1.	2008/04～2011/03	プリオン病発症メカニズムの解明:プリオン蛋白質・銅イオン複合体の構造と性質若手研究（Ｂ)
2.	2011/04～2014/03	計算科学によるアミロイド形成中間体の構造解析若手研究（Ｂ）
3.	2015/04～2018/03	有機結晶のメカニカル・ドミノ多形転移の動的機構の解明挑戦的萌芽研究
4.	2016/09～2017/08	プリオンタンパク質の凝集体を選択的・高感度に検出する新しい分子イメージング技術（日揮実吉奨学会・研究助成）競争的資金等の外部資金による研究
5.	2017/04～2023/03	凝集誘起発光イメージングで「観る」プリオンタンパク質オリゴマーの形成・伝播機構基盤研究（Ｃ）（キーワード：蛋白質、生物物理、化学物理、アミロイド、脳神経疾患）
6.	2022/04～2023/03	かたちで決まるタンパク質のはたらき：タンパク質が活躍するミクロな世界を見てみようひらめき☆ときめきサイエンス
7.	2022/04～2025/03	凝集誘起発光において非断熱遷移ダイナミクスが巧みに制御されるメカニズムを捉える基盤研究（C）
8.	2021/04～2022/03	かたちで決まるタンパク質のはたらき：タンパク質が活躍するミクロな世界を見てみようひらめき☆ときめきサイエンス
9.	2018/05～2018/08	かたちで決まるタンパク質のはたらき：タンパク質が活躍するミクロな世界を見てみよう競争的資金等の外部資金による研究
10.	2017/05～2017/08	かたちで決まるタンパク質のはたらき：タンパク質が活躍するミクロな世界を見てみよう競争的資金等の外部資金による研究
11.	2016/05～2016/08	かたちで決まるタンパク質のはたらき：タンパク質が活躍するミクロな世界を見てみよう競争的資金等の外部資金による研究
12.	2015/05～2016/03	かたちで決まるタンパク質のはたらき：タンパク質が活躍するミクロな世界を見てみよう競争的資金等の外部資金による研究
13.	2015/04～2016/03	有機結晶のメカニカル・ドミノ多形転移の動的機構の解明挑戦的萌芽研究
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■ 社会的活動

1.

2015～2017

ひらめき☆ときめきサイエンス〜ようこそ大学の研究室へ〜

■ ホームページ

山本研究室

■ 教育上の能力

●作成した教科書、教材
1.	2011/08	「振動解析再入門」講義ノート（分子科学若手の会・夏の学校２０１１・第三分科会）
2.	2008/10	人生を決めた書物（岐阜大学・教養教育推進センター編・教養ブックレット Vol.1）